PROGRAMAS DE CRIBADO NEONATAL
Encuentros 2006
Fundación Sira Carrasco
Dra. Teresa Casals
NOMBRE Y APELLIDOS
Marcadores
TIR1 cut-off
ESCRIBA CON LAPIZ
buena sensibilidad
reducir detección de portadores
DNA
aumenta sensibilidad ≥ 80%
TIR2
aumenta especificidad
PAP
reduce tiempo vs DNA
neonatos para estudio genético ~ 0,5%
Estrategias en los PCN
TIR1
TIR1 / TIR2 / T. de sudor
TIR1 / F508del / TIR2
TIR1 / DNA / T. sudor
TIR1 / DNA (3 mutac.) / T. sudor (Suecia)
TIR1 / DNA (20 mutac.) / TIR2 / T. sudor (Francia)
TIR1 / TIR2 / DNA / T. de sudor
RESUMEN
Castilla y León
Cataluña
Baleares
Galicia
Extremadura
Aragón
Madrid
Murcia
TIR / DNA / U
TIR1 / TIR2 / DNA / U
TIR1 / DNA / U
TIR1 / TIR2 / DNA / U
TIR1 / TIR2 / DNA / U
TIR1 / DNA / TIR2, U
TIR / DNA vs TIR / PAP
TIR1 / TIR2 / DNA / U
1/ 4.083
1/ 5.457
1/ 4.433
1/ 10.232
PROGRAMA DE CRIBADO
NEONATAL EN CASTILLA Y LEÓN
Juan José Tellería [email protected]
Muestra de sangre en papel de filtro
Nivel de T.I.R.
< 70 ng/ml
negativo
>70ng/ml
positivo 0,9%
Estudio secuencial de
mutaciones CFTR
(> 80% de alelos)
Estudio secuencial de
mutaciones CFTR
(> 80% de alelos)
Estudio
F508del
MultiA (11,14b,17b)
Exón 7
Exón 12
Exón 13
% acumulado
61,10
73,58
78,44
81,09
83,74
Capacidad de detección de mutaciones
en enfermos FQ
Ambos alelos
Un alelo
Ningún alelo
70,12%
27,24%
2,64%
Estudio secuencial de
mutaciones CFTR
(> 80% de alelos)
2 mutacs.
1 mutac.
No mutac.
positivo
diagnóstico
negativo
92,1% de positivos
a TIR
confirmación
Test del sudor
positivo
2,6% de positivos
a TIR
Test del sudor
negativo
-Consejo genético y
estudio de los padres.
-Seguimiento???
1999 - 2005
Muestras estudiadas :
126.578
IRT>70 ng/mL
1.207 (0,95%)
Enfermos FQ
31 (1/4.083)
Portadores
64 (1/18,9%)*
* De las muestras IRT>70 ng/ml
Enfermos
Mutaciones
10
F508del HOMOCIGOTOS
(33%)
16*
F508del + OTRAS
(50%)
5
NO F508del EN NINGÚN ALELO
(17%)
Frecuencia alélica de F508del*
58,3%
* 2 de ellos fueron gemelos monocigotos. Para calcular las frecuencias alélicas se
consideraron como un solo caso
PROGRAMA DE CRIBADO
NEONATAL EN CATALUÑA
Antoni Maya [email protected]
MARCADORES MÁS UTILIZADOS EN LA DETECCIÓN NEONATAL DE F.Q.
Estudio de la TIR (bioquímico)
TIR
Estudio del DNA (mutacional)
DNA
Estudio combinado (TIR+DNA)
TIR
Programa de Cataluña
TIR
+
±
DNA
TIR
±
DNA
PROTOCOLO DE CRIBADO NEONATAL DE LA FIBROSIS QUÍSTICA EN CATALUÑA
Centros maternales 71
CRIBADO NEONATAL F.Q.
(2-5 días)
TIR-1 < 120 NG/ML
U. Cribado 1
U. Genética 1
U. Clínicas 3
TIR-1
TIR-1 > 120 NG/ML
(25-40 días) TIR-2
SIN TIR-1
PETICIÓN 2ª MUESTRA
TIR-2 < 60 NG/ML
TIR-2 > 60 NG/ML
SIN TIR-2
DETECCIÓN (-)
DETECCIÓN (+)
SIN 1-2 TIR
PROTOCOLO
NO PROTOCOLO
31 MUTACIONES CFTR
TEST DEL SUDOR
NO MUTACIÓN 1 MUTACIÓN
2 MUTACIONES
DETECCIÓN (-)
FENOTIPO FQ
Cl < 60 meq/L
Cl > 60 meq/L
ESTUDIO DEL GEN CFTR
NO MUTACIÓN
1 MUTACIÓN 2 MUTACIONES
CASOS FUERA DE PROTOCOLO
CAUSAS QUE INVALIDAN LA DETERMINACIÓN DE TIR
Sin TIR1
Sin TIR2
Muestra < 48 horas
31
Muestra > 40 días
Muestra insuficiente
25
Sin muestra
9
Pretérmino
13
Antecedentes familiares
5
Transfusión
13
Ingreso hospitalario
3
Íleo meconial
1
Íleo meconial
8
Sin muestra
8
n = 98
n = 290
272
RESULTADOS DEL CRIBADO NEONATAL DE FIBROSIS QUÍSTICA EN
CATALUÑA
Recién nacidos analizados hasta 31/12/2005 = 452.430
Período evaluado : 09/1999 a 12/2004
Número
casos
Recién nacidos analizados
371.134
Positivos TIR-1
5.402
Estudios genéticos realizados
1.718
• Por protocolo TIR-1 y 2 (+)
1.468
• Por fuera de protocolo
250
Nº recién nacidos con mutación
166
CF confirmadas
68
% sobre
la muestra
Frecuencia
100,00
1,45
0,46
0,39
0,06
0,044
1/2.236
0,018
1/5.457
ESTUDIO GENÉTICO
A) PCR / OLA 31 mutaciones
B) Análisis completo gen CFTR
Muestras
CF / CF
CF / -
1.718
33
133
FQ
Portador
CF/variante
29 CF / CF
3 CF / -
70
31
ESTUDIO CLÍNICO EN LOS CASOS DIAGNOSTICADOS DE FQ.
(n=68) Septiembre 1999-Diciembre 2004
TEST DEL SUDOR
MANIFESTACIONES CLÍNICAS
Casos
Genotipo T. sudor + T. sudor CF/CF
33
-
Íleo meconial
Insuf. pancreática39
Cultivo + (Ps. y St.)
Asintomáticos
CF/-
32
101
10
%
15
60
33
51
2
3
DIAGNÓSTICO TARDÍO
“FALSO NEGATIVO”
1 neonato TIR1 96ng/ml [F508del] + [F508del]
“ABANDONO DEL PROGRAMA”
1 Población magrebí [L227R] + [L227R]
1 Prematuro gemelar [F508del] + [F508del]
COSTES DEL CRIBADO NEONATAL DE LA FIBROSIS QUÍSTICA
Estimación sobre 80.000 recién nacidos/año y protocolo TIR±TIR±DNA
Cribado bioquímico:
Detección individual de FQ
6€
Detección conjunta PKU+HC+FQ
3€
Cribado genético (coste por muestra analizada):
A) PCR / OLA 31 mutaciones
67 €
B) Análisis completo gen CFTR
901 €
GENOTIPOS CF/CF EN 65 AFECTADOS
F508del / F508del
17
F508del / 1078delT
1
F508del / G542X
5
F508del / 296+3insT
1
F508del / N1303K
4
F508del / F587I
1
F508del / L206W
3
F508del / A561E
1
F508del / Q890X
2
F508del / 3849+1G>A
1
F508del / E92K
2
F508del / W1089X
1
F508del / R1066C
2
G542X / R553X
1
F508del / 2183AA>G
2
N1303K / R334W
1
F508del / 1811+1,6kbA>G 1
N1303K / L206W
1
F508del / 2789+5G>A
1
N1303K / 3272-26A>G
1
F508del / R347H
1
1811+1,6kbA>G / 2711delT
1
F508del / R347P
1
711+1G>T / L206W
1
F508del / 2752-26A>G
1
R347P / 2183AA>G
1
F508del / 1812-1G>A
1
I507del / 1677delTA
1
F508del / A1006E, 5T
1
I507del / Q890X
1
F508del / 3272-26A>G
1
L227R / L227R
1
F508del / ?
3
F508del / CFTRdel20
1
GENOTIPOS EN PORTADORES
F508del / -
43
1609delCA / -
1
R117H / -
7
S549R / -
1
G542X / -
4
G85E / -
1
711+1G>T / -
3
I507del / -
1
R334W / -
2
W1282X / -
1
2183AA>G / -
2
R347H / -
1
R1162X / -
1
1078delT / -
1
2789+5G>A / -
1
15 Genotipos / 70 portadores
GENOTIPOS CF / VARIANTE
F508del / 5T
9
F508del / Y1014C
1
R117H / 5T
1
R117H / R1162L
1
2789+5G>A / 5T
1
R117H / R170H
1
F508del / 1716G>A
4
R117H / Q1352H
1
F508del / R75Q
2
G542X / A120V
1
E725K / R75Q
1
S549R / S1235R
1
F508del / L997F
2
R334W / L967S
1
R117H / L997F
1
N1303K / F1052V
1
G85E / L997F
1
W1282X / R74Q
1
18 Genotipos / 31 neonatos
PROGRAMA DE CRIBADO
NEONATAL EN BALEARES
Jordi Rosell [email protected]
Menorca
Centro Insular
Conselleria
Ibiza-Formentera
Centro Insular
Conselleria
Mallorca
Mallorca
Maternidades
Maternidades
Centros
Centros salud
salud
Laborat.
Laborat.
Carmen
Carmen
Conselleria
Conselleria de
de
Salut
Salut ii Consum
Consum
Registro
Registro
Padres
Padres
HUSD
HUSD
Laborat.
Laborat. Neonatal
Neonatal
Análisis
Análisis TIR
TIR
TIR < 60 ng/mL
Genética
Estudio
mutaciones
Gabinete pediatria
Aviso padres
Test de sudor
TIR > 60 ng/mL
(Repetida por duplicado)
Pediatria HUSD
Laboratorio
Informe final
Mutaciones y
test de sudor
normal
Presencia de
mutaciones y/o
test de sudor
patológico
Resultados
negativos
Resultados
Positivos
2001
2002
2003
2004
2005
Recién
nacidos
9858
10420
10655
10792
> 11000
Analizados
9178
9736
10426
10560
93%
93%
97%
98%
11000 ?
?
Estudio
molecular
37
36
32
52
60 / 15
Portador
3
2
2
2
4
Afecto
3
4
1
1
1
2001-04
41725
39900
95 %
157
9
9
1 / 4.636
COSTE
TIR
2,50 €
ESTUDIO MOLECULAR
62 €
TEST SUDOR
25 €
TIR
MOLECULAR
TEST SUDOR
TOTAL
Sobre 11000 / 1 % (+)
27500
6820
2750
37070
€
€
€
€
PROGRAMA DE CRIBADO
NEONATAL EN GALICIA
[email protected] [email protected]
Estudio Piloto Detección Precoz
Fibrosis Quística
• Inicio
Año 2003 como Programa Piloto. Aprobado por el Comité de Investigación
Clínica de Galicia.
• Área de Cobertura
Galicia
• Tasa de Cobertura
98,7% de los recién nacidos vivos
• Método de cribado
Determinación de tripsinógeno en sangre por Inmunofluorescencia (AutoDelfia)
• Método confirmación Cloro en sudor
Potenciometría con dilución (3100 SWEAT-CHEK)
• Métodos confirmación genética
– INNO-LIPA
– Secuenciación completa gen CFTR
Resultados y Prevalencia en
Cribado Neonatal
2003
Niños analizados
19.911
2004
2005
Total
20.424 21.057 61.392
Frec.
98,7%
Tripsinógeno
elevado 1ªmuestra
139
154
164
457
0,74%
Tripsinógeno
elevado 2ªmuestra
--
28
56
84
0,20%
105
24
49
178
Portadores
5
4
s/d
9
1:4.482
Fibrosis Quística
2
2
2
6
1:10.232
Estudio genético
Comparación una muestra con
doble muestra
Una única
muestra
Doble
muestra
(2003)
(desde 2004)
99,27%
99,81%
Sensibilidad*
100%
100%
Especificidad
99,27%
99,81%
0,013
0,048
Valor predictivo negativo*
1
1
Ratio probabilidad positiva
136,11
518,46
Precisión
Valor predictivo positivo
* No valorable, hasta ahora ningún caso falso negativo
Protocolo de Cribado Inicial
>69 ng/mL
Determinación de
tripsinógeno
en sangre
<70 ng/mL
Solicitud de
2ª muestra
>39 ng/mL
Mutaciones CFTR
positivo
F. QUÍSTICA
Confirmada
F. QUÍSTICA
posible
>60 mEq/L
Cloro en sudor
>39 mEq/L
negativo
<40 ng/mL
NORMAL
<40 mEq/L
Resultados y Prevalencia en
Cribado Neonatal
2003
Niños analizados
19.911
2004
2005
Total
20.424 21.057 61.392
98,7%
Tripsinógeno
elevado 1ªmuestra
139
154
164
457
0,74%
Tripsinógeno
elevado 2ªmuestra
--
28
56
84
0,20%
105
24
49
178
Portadores
5
4
s/d
9
1:4.482
Fibrosis Quística
2
2
2
6
1:10.232
Estudio genético
Casos positivos Cribado
Año
TIR
ng/mL
Cl
mEq/L
Alelo 1
Alelo 2
2003
76
elevado
?
?
2003
177
elevado
DF508
?
2004
96
76
DF508
R334W
2004
105
81
DF508
R1162X
2005
223
>100
DF508
2176insC
2005
76
60
711+1G->A
V232D
Resultados en Cribado
Mutación
deltaF508
L997F
R334W
R668C
2176InsC
711+1G->A
D1270N
F1052V
G576A
I148T
I807M
L206W
L967
L967S
M952I
R1162X
R74W
R75Q
S42F
V232D
Y1014C
TOTAL
2003 2004 2005 Total
2
3
1
6
1
2
3
1
1
2
2
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
18
8
4
30
Protocolo de Cribado Actual
>69 ng/mL
Mutaciones CFTR
Positivo
Negativo
Dos alelos
Determinación de
Tripsinógeno
en sangre
Un alelo
<70 ng/mL
Cloro en sudor
F. QUÍSTICA
Confirmada
F. QUÍSTICA
Posible
Secuenc. Seguim,...
NORMAL
>39 mEq/L
<40 mEq/L
Panel de mutaciones Cribado
Neonatal Galicia
711+3A-T
1078delT
1154insTC
1609delCA
1717-1A
1717-8G-A
1811+1.6kbA-G
1812-1G-A
1898+1A
1898+3A-G
1949del84
2143delT
2176insC
2183AA-G
2184delA
2184insA
2603delT
2789+5G-A
2869insG
3120+1A
3199del6
3272-26A-G
3601-111G-C
3659delC
3667del4
3849+10KbC-T
3849+4G
3860ins31
3876delA
3905insT
394delTT
4005+1G-A
405+1A
405+3C
621+1G-T
711+1G-T
711+5G-A
712-1G-T
875+1G-A
936delTA
A1006E
A120T
A455E
A559T
A561E
D1152H
D1270N
del2,3_21kb
DELTAF508
DELTAI507
E585X
E60X
E692X
E92K
F1052V
F1074L
F316L
F508C
G1244E
G178R
G314E
G330X
G480C
G542A
G542X
G551D
G576A
G673X
G85E
G85V
H199Y
I148T
I807M
K710X
L1065R
L206W
L558S
L571S
L967S
L997F
M1101K
M952I
N1303K
P205S
P5L
POLI-Tn
Q1100P
Q1281X
Q1313X
Q30X
Q493X
Q552X
Q890X
R1066C
R1158X
R1162X
R117C
R117H
R334W
R347H
R347P
R352Q
R553X
R560T
R668C
R709X
R74W
R75Q
R851X
S1045Y
S1235R
S1251N
S42F
S549N
S549R
T351S
T582R
V232D
V520F
W1089X
W1282X
Y1014C
Y1092X
Y122X
Y1381X
Valoración final
• Detección precoz fiable con alta especificidad y
sensibilidad, aunque parece admitir mejora con la
determinación simultánea de PAP y tripsinógeno
• Económico. Mismo precio que la determinación de TSH.
• Rápido. Resultados en el día en el caso de tripsinógeno y al
mes en el cribado genético.
• Beneficio del diagnóstico precoz, previo a la aparición de
sintomatología: Prevención de malnutrición, infecciones,
etc.
Mutaciones localizadas en 82 casos
FQ seguidos en Galicia
Mutación
• 21 casos sin identificar
ninguna mutación
• 21 casos homocigotos
DeltaF508
• 7 casos ausencia
DeltaF508
DeltaF508
G542X
R1162X
2176insC
621+1G>T
G85E
R1066C
V232D
Y1381X
5T-12TG-V470
685E
711+1G>A
711+1G>T
7Tn9Tn
9T-10TG-M470
D1270N
G85V
IVS8CA
R334W
R74W
Y1092X
Desconocido
Total
Cantidad
%
74
5
3
2
2
2
2
2
2
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
58
45%
3%
2%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
1%
35%
164
100%
PROGRAMA DE CRIBADO
NEONATAL EN EXTREMADURA
Jesús María Remón Alvarez-Arenas [email protected]
TOMA DE MUESTRA DE SANGRE DE TALÓN
ENVÍO A LA COORDINACIÓN PARA REGISTRO
LABORATORIO - VALORACIÓN DE LA IRT (¿?)
< 70 ngr./ml.
> 70 ngr./ml.
Sale del Programa
Nueva muestra
< 70 ngr./ml.
> 70 ngr./ml.
Test de sudor
Estudio de mutaciones
(33 mut. y polimorfismos)
POBLACIÓN Y RESULTADOS
1ª IRT
normal
1ª IRT NO
normal
2ª IRT
normal
Confirmar
estudio
2003
2004
2005
8.576
9.087
8.795
51
50
47
47
37
35
4
13
12
PROGRAMA DE CRIBADO
NEONATAL EN ARAGÓN
Mª Teresa Calvo [email protected]
Protocolo
TIR a partir de las 48 h.
< 60 ng/ml
> 60 ng/ml
repetir
> 60 ng/ml
INFORME
< 60 ng/ml
INFORME
Mutaciones CFTR
No mutación
1 mutación
TIR día 21
< 40 ng/ml
INFORME
> 40 ng/ml
2 mutaciones
Unidad FQ
Test sudor normal
Test sudor elevado
Fibrosis Quística
INFORME
Mutaciones CFTR
78 (19%)
30 (7%)
No mutación
una mutación
dos mutaciones
300 (74%)
Muestras estudiadas:
408
Mutaciones CFTR
Mutación
Número (%)
p.F508del
75 (58,14)
p.G542X
12 (9,30)
p.L206W
8 (6,20)
p.N1303K
7 (5,43)
p.I507del
7 (5,43)
c.1609delCA
5 (3,88)
p.S549R
2 (1,55)
p.Q890X; c.712G>T; c.2789+5G>A;
c.1811+1,6kbA>G; c.71+1G>A;
c.2184insA; c.1716G>A; p.Y1092X;
p.I148T; p.R347P; c.1717 1G>A;
c.3272- 26A>G; p.R117H
1 (0,78)
Prevalencia estimada: 1/5.109
R.N. con FQ: 2-3/año
Portadores: 374 RN
Costo de la prueba: 3 €
PROGRAMA DE CRIBADO
NEONATAL EN MADRID
Elena Dulín [email protected]
Cribado Neonatal FQ en la CM
ACTUALMENTE: No se realiza
PREVISIÓN FUTURA: Realizar estudio piloto durante al
menos seis meses (35.000 RN)
OBJETIVO: Prevalencia y Oportunidad de Incorporación
M u estra > 4 8 h o ra s W # 9 0 3
L A B . D E T E C C IÓ N
l'AFDPHE
T IR > 5 5 m g /d L sa n g re
T IR < 5 5 m g /d L sa n g re
C o n firm ar (2 x ) en la m ism a m u estra
T IR > 6 5 m g /d L sa n g re
L A B . B IO L O G ÍA
M OLECULAR
E stu d io d el g en C F T R
M /M
U n id a d
S E G U IM IE N T O
A n o rm a l (> 6 0 m E q /L )
S E G U IM IE N T O
ENFERM EDAD
N o rm a l
M /X
TEST D EL SU D O R
(4 0 -5 9 m E q /L )
S E G U IM IE N T O
3, 6 Y 12 M ESES
X /X
T IR < 4 0 m g /d L sa n g re
C o n tro l 2 1 d ías (S & S )
T IR > 4 0 m g /d L sa n g re
N o rm a l
C O N S E J O G E N É T IC O
M /X
M u estra > 4 8 h o ra s W # 9 0 3
L A B . D E T E C C IÓ N
204.749 RN
T IR > 5 5 m g /d L sa n g re
T IR < 5 5 m g /d L sa n g re
C o n firm ar (2 x ) en la m ism a m u estra
1177 (0.58%)
T IR > 6 5 m g /d L sa n g re
L A B . B IO L O G ÍA
M OLECULAR
N o rm a l
E stu d io d el g en C F T R
T IR < 4 0 m g /d L sa n g re
48 = 1: 4266
45 (4%)
116 (10%)
1028 (86%)
U n id a d
S E G U IM IE N T O
43 (89.5%)
A n o rm a l (> 6 0 m E q /L )
S E G U IM IE N T O
ENFERM EDAD
M /M
M /X
TEST D EL SU D O R
(4 0 -5 9 m E q /L )
S E G U IM IE N T O
3, 6 Y 12 M ESES
X /X
C o n tro l 2 1 d ías (W # 9 0 3 )
T IR > 4 0 m g /d L sa n g re
N o rm a l
C O N S E J O G E N É T IC O
M /X
M u estra > 4 8 h o ra s S & S
L A B . D E T E C C IÓ N
T IR > 5 0 m g /d L y P A P > 1 .0 n g /m L
T IR > 1 0 0 m g /d L y P A P > 1 .0 n g /m L
T IR < 5 0 m g /d L y P A P < 1 .0 n g /m L
T IR > 5 0 m g /d L y P A P > 1 .8 n g /m L
N o rm a l
0 .7 2 %
0 .2 4 %
U n id a d
S E G U IM IE N T O
A n o rm a l (> 6 0 m E q /L )
S E G U IM IE N T O
ENFERM EDAD
TEST D EL SU D O R
(4 0 -5 9 m E q /L )
S E G U IM IE N T O
3, 6 Y 12 M ESES
N o rm a l
Resumen
204.748
TIR (65) / ADN
TIR(50) / PAP
TIR
1177 (0.58%)
3890 (1.89%)
CFTR
2 Mutaciones
1
0
TIR 21 días
45 (3.8%)
116 (9.8%)
1028 (87.3%)
111 (10.8%)
TIR (1x)
TIR(2x)
Test sudor
224 (0.11%)
501 (0.25%)
329 (0.16%)
FQ
48
1.- A Munck el al. Archives de Pediatrie 12 (2005):646-649
2.- J Sarles el al. J Pediatr 2005;147:302-5
48
Coste Estimado
100.000
Precio Unitario (€)
TIR / ADN
TIR / PAP
TIR
2.5 (100%)
250000
250000
CFTR
120 (0.58%)
69600
2600
PAP
4.5 (1.89%))
-
18000
Test sudor
46 (0.11%- 0.25%)
5000
11500
TIR 21 días
23 (0.5%)
11500
Seguimiento
400 (0.4%)
16800
Total (€)
352900
1.- A.Munck el al. Archives de Pediatrie 12 (2005):646-649
2.- J Sarles el al. J Pediatr 2005;147:302-5
282100
Estudio Piloto......
ESTUDIO ANÓNIMO NO RELACIONABLE: 35000 RN
CENTRO CRIBADO NEONATAL DE LA CM: HGUGM
• Medición de TIR y PAP
BIOLOGÍA MOLECULAR: HGUGM
• kit: CFTR19 y CFTR17+Tn
COMPARAR ESTRATEGIAS: TIR/ADN versus TIR/PAP
CONSENTIMIENTO INFORMADO  ADN
PROGRAMA DE CRIBADO
NEONATAL EN MURCIA
Asuncion Fernandez Sanchez [email protected]
Protocolo Propuesto
Muestra sangre papel filtro (3-6 días), nivel IRT
> cut-off
Negativo
Positivo
Solicitar 2ª muestra, <20 – 30dias
> cut-off
< cut-off
Negativo
Positivo
Est. Mut. en CFRT, kit 31 mut +A1006E + K710X
2 mut
< cut-off
1 mut
Sin mut
Test sudor
Otras: D-HPLC, secuen, MLPA,
Heterocigoto/
AsesorGenético
+
mut
FQ (Unidad)
normal
-
RESULTADOS
MUTACIONES
Nº cromosomas
%
Nº pacientes
%
F508del *
50
34.2
40
54.8
G542X *
18
12.3
17
23.3
L206W
8
5.5
7
9.6
K710X
6
4.1
5
6.8
A1006E + 5T
5
3.4
5
6.8
N1303K *
4
2.7
4
5.5
2869insG
4
2.7
4
5.5
G85E *
4
2.7
2
2.7
3849 + 10kbC>T *
4
2.7
4
5.5
1811+1.6bkA>G
3
2.05
3
4.1
R334W *
3
2.05
3
4.1
2789 + 5G>A *
2
1.4
2
2.7
21833AA>G *
2
1.4
2
2.7
Q890X
2
1.4
2
2.7
711+1G>T *
2
1.4
2
2.7
No encontrado
9
6.2
7
9.6
No hecho
6
4.1
3
4.1
• Incluidas en el KitPCR-OLA V3 de Abbott
El Kit PCR-OLA V3 (Abbott) incluye únicamente el 42.1% (16/38) de las
mutaciones halladas en la población murciana y permitiría diagnosticar (por
encontrar las 2 mutaciones) el 57.5% de los pacientes.
Mutaciones de FQ relativamente frecuentes en Murcia no incluidas en el kit
PCR-OLA V3 (Abbott)
•
•
•
•
•
L206W: 7 pacientes (1 homozigoto)
A1006E: 5 pacientes
K710X: 5 pacientes (1 homozigoto)
2869insG: 4 pacientes
1811+1.6kbA>G: 3 pacientes
Análisis económico: presupuesto
Número
1ª IRT
19.000 recién nacidos
2 ª IRT
800* (400pacientes)
(análisis por duplicado)
ADN
- extracción
-Kit (30 mut)
-D-HPLC/secuenciación
100
100
15
TOTAL
Coste total euros
(ptas)
40.000
(6.655.440)
1.600
(266.218)
100 (16.700)
1.000 (167.000)
1.500 (250.000)
44.200
(7.355.358)
Se precisa la incorporación de 2 TEL (48.898 euros) y un auxiliar
administrativo al Centro de Bioquímica y Genética Clínica (21. 429 euros)
Total coste programa 114. 527 euros
Total coste por paciente FQ (¿frecuencia?)
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Presentación de PowerPoint - Fundación `Sira Carrasco`