Estructura Viral Genoma
Objetivos

Al finalizar la clase el estudiante podrá:




Conocer la relación entre la clasificación Baltimore y
la estructura del genoma.
Conocer la estructura y complejidad de los genomas
virales.
Comparar y contrastar los genomas virales en
términos de su configuración, grado de dependencia
de la célula hospedera y estratégias de expresión.
Conocer la configuración espacial de los genomas
dentro de la cápsula viral.
Estructura Genoma y la
Clasificación Baltimore

Estructura genómica



Composición del genoma
Arreglo espacial en la partícula viral
Genomas

Depósito de información




ácido nucleico : Producir, replicar y transmitir un virus
Especificar proteínas - Producir mRNA
Unidad en la diversidad - Procesos evolutivos
Templado - sintesis de genoma progenie
Estructura Genoma y la
Clasificación Baltimore

Información codificada
en el genoma viral:





Replicación
Montaje y empaque
ciclo de vida viral
Evasión
Mecanismos de infección
Estructura Genoma y la
Clasificación Baltimore
Estructur66 Genoma y la
Clasificación Baltimore

Información codificada
en el genoma viral:





Replicación
Montaje y empaque
ciclo de vida viral
Evasión
Mecanismos de
infección
Estructura Genoma y la
Clasificación Baltimore

Información codificada en el genoma viral:





Replicación
Montaje y empaque
ciclo de vida viral
Evasión
Mecanismos de infección
Estructura Genoma y la
Clasificación Baltimore

Información codificada en el genoma viral:





Replicación
Montaje y empaque
ciclo de vida viral
Evasión
Mecanismos de infección
Estructura Genoma y la
Clasificación Baltimore

Información codificada en el genoma viral:





Replicación
Montaje y empaque
ciclo de vida viral
Evasión
Mecanismos de infección
Estructura Genoma y la
Clasificación Baltimore
Clasificación Baltimore

Categorias

I


II


III


IV


V


VI

± DNA
+ DNA
± RNA
+ RNA  - RNA
- RNA
+ RNA  - DNA
Clasificación Baltimore

Categorias

I


II


III


IV


V


VI

± DNA
+ DNA
± RNA
+ RNA  - RNA
- RNA
+ RNA  - DNA
Complejidad del Genoma


Siete clases de genomas distintos
Genomas virales pueden contener:









DNA o RNA
DNA con segmentos cortos de RNA
DNA o RNA con proteínas covalentemente unidas.
Cadenas sencillas + o -; “ambisense”
Cadenas dobles
Linear
Circular
Segmentado
Con huecos (gaps)
Estructura del Genoma: dsDNA


Linear o circular
RNA polimerasa dependiente del DNA

Viral o hospedero
Estructura del Genoma: dsDNA
Polyomaviridae
Adenoviridae
Estructura del Genoma: dsDNA
Polyomaviridae overlapping genes
Adenoviridae
strand displacemente replication
Estructura del Genoma: dsDNA
Herpesviridae
Poxviridae
Estructura del Genoma: dsDNA
Herpesviridae - Isomeros de genoma
Estructura del Genoma: dsDNA,
Circular y con huecos
Los huecos deben ser
rellenados antes de replicar
el material genético
•
Estructura del Genoma: dsDNA,
Circular y con huecos
Hepadnaviridae
Estructura del Genoma: ssDNA


Cinco familias
Síntesis del DNA debe preceder a la producción
de mRNA.
Estructura del Genoma: ssDNA
Circoviridae
Parvoviridae
Estructura del Genoma: dsRNA



7 familias
1 a 7 segmentos
RNA (-) es copiado  mRNA

RNA polimerasa dependiente de RNA de origen viral
Estructura del Genoma: dsRNA
Reoviridae
Estructura del Genoma: ss RNA (+)



22 familias, 22 generos
Transcriben a proteínas
por el hospedero
Replicación


Genoma +  Genoma –
Genoma -  Genoma +
Estructura del Genoma: ss RNA (+)
Coronaviridae
Flaviviridae
Picornaviridae
Togaviridae
Estructura del Genoma: ss RNA (+)
con intermediario de DNA

Transcriptasa reversa


DNA polimerasa dependiente de RNA de origen viral
dsDNA  mRNA
Estructura del Genoma: ss RNA (+)
Retroviridae
Estructura del Genoma: ss RNA (-)


7 familias, 3 generos
-RNA  +RNA

RNA polimerasa dependiente de RNA
Estructura del Genoma: ss RNA (-)
Orthomyxoviridae
Arenaviridae;
Bunyaviridae; Ambisense
Configuración Espacial



Estructuración secundaria o terciaria
Tamaño del genoma  grado de
compresión del material genético.
Algoritmos de doblamiento en base a la
energía libre óptima y subóptima.
Configuración Espacial

Importancia

Usos o funciones




Clasificación
Replicación
Traducción
Ensamblaje
Configuración Espacial : Replicación
Configuración Espacial : Replicación
Configuración Espacial : Replicación
Configuración Espacial: Traducción
Configuración Espacial: Ensamblaje
Mecanismos de obtener la
información del genoma viral
Mecanismos de obtener la
información del genoma viral
Mecanismos de obtener la
información del genoma viral
Mecanismos de obtener la
información del genoma viral
Mecanismos de obtener la
información del genoma viral
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