El Genoma en el Ganado de
Carne
Dr. Carlos Ignacio Ortiz Espinosa
Departamento Técnico 2009
Historia
►
La vaca doméstica (Bos taurus)
contiene unos 22.000 genes
diferentes, 80% de los cuales son
idénticos a los genes humanos
►
permitir la posibilidad de llevar la
producción de leche y carne a
una mejor calidad
►
puede significar una mejor
comprensión de la salud bovina y
lo que es mas importante aun, del
propio genoma humano!
Historia
►
Tras que pasaran seis años de su vida
trabajando;
el
grupo
de
300
investigadores de 25 países lograron
descifrar completamente la secuencia
►
El “Proyecto de Secuencia del Genoma Bovino” fue realizado con
vacas Hereford, originarias de Gran Bretaña,
►
Se descubrió que la organización de los cromosomas en humanos
está mucho más cercana al modelo vacuno que del de los
roedores utilizados en laboratorios para estudiar tratamientos
factibles a las enfermedades humanas.
Instituciones y Organismos
►
USDA 35 MILL DE DÓLARES
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Baylor College of Medicine, Houston,
Texas
►
Instituto Nacional de Salud, Dr. Raynard
Kington
►
Instituto de Genética Humana en la
Universidad de München, Alemania.
►
Universidad de Washington,
Departamento de Ciencia Animal y
Escuela de Ciencias biológicas.
El Cromosoma 14
 El
cromosoma 14 (BTA14) ha sido explorado para distintos locis de rasgos
cuantificables (QTL) y genes de importancia económica tanto en ganado de
leche como de carne.
 En la Universidad de Washington, más de 40 ivestigadores encontraron cerca
de 126 QTL para el genoma del ganado de carne. La mayoria encontrados de la
región 15 a la 45 del cromosoma.
 Rasgos de importancia económica:
El Cromosoma 14
 Rasgos de importancia económica:
Ganancia diaria promedio pre-destete
(PrWADG)
Ganancia diaria promedio post-destete
(PoWADG)
Peso al nacimiento (BW)
Peso de la canal (CW)
Espesor de grasa dorsal (BFT)
Marmoleo (BMS)
Promedio de peso corporal (ABW)
Calidad de canal (EQT)
Tasa de crecimiento (GR)
Area del Rib eye (REA)
Estructura poblacional
K=2
K=3
K=4
Cada individuo es representado por una barra vertical, dividido entre segmentos de
colores con la longitud de cada segmento representando la proporción del genoma
individual de 2,3 o 9 poblaciones ancestrales. Las razas son separadas por líneas negras.
 Razas: NDA, N´Dama; SHK, Sheko; NEL, Nelore; BRM, Brahman; GIR, Gir; SGT, Santa Gertrudis;
BMA, Beefmaster; ANG, Angus; RGU, Red Angus; HFD, Hereford; NRC, Norwegian Red; HOL, Holstein;
LMS, Limousin; CHL, Charolais; BSW, Brown Swiss; JER, Jersey;
GNS, Guernsey; PMT, Piedmont,RMG, Romagnola.
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Mapa genomico
Bos taurus
Razas intermedias
Bos indicus
 Componentes principales de todos los SNPs. Las razas Bos taurus permanecen
separadas de las razas Bos indicus, y las razas intermedias.
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Regiones genomicas
asociadas a diferentes
rasgos
Eficiencia alimenticia
ZRANB3, R3HDM1
Segmentación mesodermo en mamíferos
WIF1
Proteoglícanos, desarrollo del CNS
SPOCK1
Autismo idiopatico humano
NBEA
Activador del sistema del complemento
NMT1, DCAKD, C1QL1
Inmunodeficiencia severa combinada
NLGN3 al DGAT2L6
Protección extracelular antioxidante
PPARGC1A, DHX15
Motor molecular multisubunitario
DNAH9
Expresado en tejido olfatorio
ZNF187
Candidatos susceptibles al autismo humano
AUTS2
Muerte cardiaca inducido por estrés y ejercicio RYR2
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SmartGene para Carne
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Es un proyecto que proporciona información
para la evaluación genética en la industria de
carne en Australia, proporciona nuevos EBVs
e incrementa la confiabilidad de algunos
valores de cruzamiento.
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La TERNEZA es la característica más
deseada por los consumidores.
►
Hay efectos significativos T1 y T2 para
razas inglesas
►
T1, T2 y T3 para razas adaptadas al trópico.
►
Éstos marcadores le permiten al ganadero
identificar animales que son geneticamente
predispuestos a producir carne más blanda.
SmartGene para Carne
•Fase 1. Genotipificación utilizando 12,000 muestras de DNA
Todos los animales se prueban para 12 pruebas DNA GeneStar: 4 Ternesa,
4 en Marmoleo y 4 en Eficiencia alimenticia.
• Fase 2. Estimación de los parámetros para calcular el EBV, en base a los
resultados de las pruebas de DNA y medidas de rendimiento (ternesa, grasa
intramuscular o índice de masa corporal, marmoleo y eficiencia alimenticia en
animales con un pedigrí completo.
Así entonces tenemos marcadores: T1 – T4, M1 – M4 y FE1 – FE4.
•Fase 3. Desarrollo de un Software para calcular los Valores de cruzamiento
(EBVs).
SmartGene
►
El proyecto de SmartGene para Carne se basa
en el registro de datos por 2 proyectos de CRC
Beef:
– BEEF CRCI: Contempla 7 razas puras y 4 razas
templadas (Angus, Hereford, Murray Grey y
Shorthorn) 3,229 animales y 3 razas adaptadas al
trópico (Brahman, Santa Gertrudis y Belmont Red)
3,615 animales.
– BEEF CRCII: Contempla razas adaptadas al trópico,
Brahman Puro (2,039 animales) y otras tropicales (2,400
animales)
►
Y por 2 campos de base de datos de
Asociaciones de Raza:
– Prueba de Progenie Angus: Australianos (415
individuos)
– Prueba de Progenie Durham: Prueba de progenie
Shorthorn (347 individuos)
GeneSTAR DNA
Resultados de prueba
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Como resultado de 0, 1 o 2 estrellas correspondientes a
0, 1 o 2 copias (alelos) de la forma favorable de cada
gen o marcador.
►
En el caso de la Terneza
– El número de estrellas corresponde a las medidas registradas de “la fuerza de
corte” del longissimus dorsi” . Entre más bajo sea el valor de la fuerza de corte,
mayor grado de terneza (más estrellas).
►
En el caso del Marmoleo
– Los registros están basados en animales alimentados con grano por arriba de
180 días.
– Entre más estrellas, la grasa intramuscular es mayor en el bistek.
GeneStar
Eficiencia Alimenticia
►
El incremento en el número de estrellas
corresponde a individuos con alta eficiencia
alimentica, óptimo consumo diario de alimento
y excelente conversión alimenticia.
Glosario de términos técnicos
 Marcardor de DNA: Una secuencia única de DNA genéticamente
asociada con un rasgo en particular y utilizada para identificar un
individuo o célula portadora del marcador.
 Genotipo: Genética propia de un animal (en base a 1 o varias
series de marcadores genéticos o por todos sus genes)
 Fenotipo: Rendimiento medible. Lo observable o propiedades
medibles de un animal. La combinación de efectos genéticos y medio
ambientales sobre el rendimiento.
 Alelo: Una forma específica de un gen o marcador genético
 Gen: La secuencia funcional de DNA que codifica para una proteína
específica.
Gracias !!
“ Estar preparado es importante,
saber esperarlo es aún más, pero
aprovechar
el
momento
adecuado es la clave de la vida.”
Arthur Schnitzler
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