Jack Ward
American Hereford Association
23 de Julio, 2012
 Prueba
y Validación
 Migración de Microsatélites a SNPs
 Implementación
 Futuro
 Aprox
1200 toros Hereford americanos
poseen análisis de genotipo 50K y son los que
han formado la población de prueba y
validación de un panel específico de
marcadores.
 Estos
toros han sido utilizados en distintos
proyectos incluídos US-MARC 2000 Toros,
Caract-Peso, Investigación de Anormalidades
Genéticas y Genotipado de toros de alta
precisión y de toros jóvenes de la American
Hereford Association (AHA) .
AHA
Caract
Prec DEP.
Correlación Nueva
Prec.
Progenie
FP
.12
.40
.18
7.4
PN
.12
.45
.20
2.1
PD
.12
.32
.16
2.2
PA
.12
.32
.16
1.2
Leche
.12
.26
.14
2.8
FPM
.12
.18
.13
1.3
Grasa
.12
.45
.20
3.1
AOB
.12
.42
.18
3.1
GI %
.12
.33
.15
1.8
 Junio 2012 Saatchi, Garrick
Prec DEP.
MBV
Correlación
Heredabilidad
Caract.
Prec. DEP
Mejorada
Progenie
Efectiva
.12
.10
.30
.12
.1
.12
.20
.30
.13
.5
.12
.30
.30
.15
1.2
.12
.40
.30
.18
2.3
.12
.50
.30
.22
4.1
.12
.60
.30
.27
6.9
.12
.70
.30
.33
11.8
.12
.80
.30
.43
21.9
.12
.90
.30
.58
52.6
Característica
Validación en Hereford
FPD
.10
PN
.18
PD
.14
PA
.17
Leche
.02
Grasa
.07
GI %
.16
AOB
.06
Característica
American Angus
American Red Angus
PN
.64
.27
PD
.67
.28
PA
.75
.23
Grasa
.70
.21
AOB
.75
.29
GI %
.80
.21
FPD
.69
.14
FPM
.73
.18
Caract.
Predicción Correlac.
US
99 Toros
UR
Correlac.
75 Toros
CA
Correlac.
59 Toros
ARG
s/relación
Correlac.
41 Toros
ARG
Relación
US
PN
.43
.22
.40
.15
.24
PD
.32
.13
.07
-.35
.23
PA
.30
.03
.12
-.27
.32
Leche
.22
.23
.09
.15
-.03
Grasa
.40
.22
.39
.02
.10
AOB
.36
.01
-.01
-.11
.18
GI %
.27
.25
.29
.17
.35
 Cambiaron
los laboratorios y tecnología de
Maxxam Analytics a GeneSeek. La plataforma
se modificó de Microsatélites a SNPs.
 Existen
4 opciones para los miembros de la AHA
- Test de Parentesco y anormalidades u$30
- H/P test-u $48
- 50K Genotipado para EG-DEP - u$85
- Parentesco y anormalidades test, EG-DEP
u$100
AHA actualiza
los
resultados.
Criador pide
Kits (pelo,
semen, sangre)
AHA los
reenvía por
correo, email o
fax a los
criadores
AHA recibe
los
resultados
GeneSeek
realiza los
test
 Combinación
utilizando un modelo
interino.
 Pedigree + MBV + Fenotipo.
 Evaluación Genética es realizada 2 x año.
 Dado que AHA tiene acceso al Pedigree,
Genotipos y Fenotipos, podemos recalcular.
los MBVs en cualquier momento.
 Continuar
colaborando con Científicos ,
otros países y demás entidades de
investigación.
 Seguir la construcción de lo población de
genotipos 50K.
 Reunir fenotipos de Características
Económicamente Importantes que son
difíciles de medir tales como Consumo de
Alimento, Fertilidad y Enfermedades.
 Comenzar con el secuenciamiento de Toros
Padres Referentes (8 Toros en 2012).
 Predicciones
Genómicas dan resultado
(leche USA, Angus, Hereford, Simmental)
 Está en su etapa inicial
 Predicciones funcionan bien dentro de
poblaciones estrechamente relacionadas.
 Fenotipos siguen siendo importantes para
la evolución de la Genómica.
 Es muy emocionante.
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Moving Forward with Genomics Aregentinean