ECUACION MAESTRA
APROXIMACION AL CALCULO
DE LA ENERGIA LIBRE DE
INTERACCION
Energia de union entre el estado unido y
separado
El calculo de la energia libre se
puede resumir de la siguiente
manera
El termino de solvatacion
Energia libre de
interaccion entre dos
moleculas
Sin solvente
Con solvente
Metodos
•
•
•
•
Metodos empiricos de tranferencia
Metodos basados en area de superficie
Parametros de solvatacion atomica
Aproximando al tratamiento electrostatico
del agua
• Modelo continuo electrostatico
Cambios conformacionales
• Cambios en la proteina
• Cambios en el ligando
Cambios de solvatacion
Cambios entalpicos
Energias de Interaccion
•
•
•
•
•
Fuerzas de corto alcance y largo alcance
Elextrostatica y Van der Waals
Constante dielectrica
Grupo funcional
Moleculas de agua cristalograficas
Calculo del movimiento
• Restriccion torsional
• Traslacional y de giro
Tablas
Seis grados de
libertad reducidos
despues de la union
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