PulseNet América Latina
4ta Reunión Internacional
Buenos Aires, 22 y 23 de junio 2006
“PFGE aplicado al estudio de Salmonella spp., Shigella spp. y
Vibrio cholerae: experiencia en Argentina”
Mariana Pichel
Servicio Enterobacterias – Departamento Bacteriología
INEI – ANLIS “Carlos G. Malbrán”
22 de junio de 2006
Red de Subtipificación Molecular para Vigilancia
de Enfermedades Transmitidas por los Alimentos
Salmonella spp.

Base de Datos Nacional
(inicio octubre 2004):

550 aislamientos, 227 patrones

22 Serovariedades incluidas
Salmonella spp.

Brotes de ETA estudiados (2004-2006):
Serovariedad
Nº
Nº
Nº
Brotes aislamientos Patrones
de XbaI
PFGE
Nº
Patrones
de BlnI
PFGE
S. Enteritidis
12
52
3
1
S. Tyhpimurium 2
15
2
2
S. Typhi
1
3
1
1
S. Heidelberg
1
15
1
1
Brotes de ETA causados por
S. Typhimurium 2005-2006
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
Brote 1
Brote 2
PFGE-XbaI
100
90
80
PFGE-XbaI
STM1676/05
. Pampa
La
25 de Mayo
.Food
STM1734/05
. Pampa
La
25 de Mayo
.Human
STM1735/05
. Pampa
La
25 de Mayo
.Human
STM1736/05
. Pampa
La
Santa Isabel
.Human
STM1737/05
. Pampa
La
Santa Isabel
.Human
STM1738/05
. Pampa
La
Santa Isabel
.Human
STM1739/05
. Pampa
La
Santa Isabel
.Human
STM1740/05
. Pampa
La
Santa Isabel
.Food
STM1741/05
. Pampa
La
25 de Mayo
.Food
STM954/05
.
Buenos
Aires
La Plata
.Human
STM3069/98
.
Buenos
Aires
La Plata
.Human
STM278/02
.
Buenos
Aires
La Plata
.Human
STM2216/98
.
Mendoza
Mendoza
.Human
STM1018/05
.
Buenos
Aires
Gran Buenos Aires
Environmental
STM1011/03
. Negro
Rio
Bariloche
.Human
STM1506/05
.
Buenos
Aires
Azul
Animal
STM1612/05
.
Buenos
Aires
Azul
Animal
STM1256/05
.
Santa
Fe
Rafaela
.Human
STM1354/05
.
Buenos
Aires
Azul
Animal
STM607/06
.
Tucumán
Tucumán
.Human
STM608/06
.
Tucumán
Tucumán
.Human
STM609/06
.
Tucumán
Tucumán
.Human
STM610/06
.
Tucumán
Tucumán
.Human
STM611/06
.
Tucumán
Tucumán
.Human
STM612/06
.
Tucumán
Tucumán
.Human
STM613/06
.
Tucumán
Tucumán
.Human
STM1903/00
.
Buenos
Aires
Azul
Animal
STM1080/05
.
Buenos
Aires
Capital Federal
.Human
STM1319/04
.
Buenos
Aires
Azul
.Animal
STM2269/05
.
Buenos
Aires
Azul
Food
Brote causado por S. Typhi (año 2004)
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
100
95
90
PFGE-XbaI
85
80
PFGE-XbaI
ST1026/02
.
Salta
.
Materia
Fecal
ST250/03
.
Salta
.
Materia
Fecal
ST 1617/04
.
Buenos
Aires
.
Hueso
ST 805/02
.
Buenos
Aires
.
Materia
Fecal
ST 1389/04
.
Buenos
Aires
.
Sangre
ST 1390/04
.
Buenos
Aires
ST1388/04
.
Buenos
Aires
.
Sangre
ST1713/04
.
Buenos
Aires
.
Sangre
ST 1309/04
.
Buenos
Aires
.
Sangre
ST659/01
.
Buenos
Aires
.
Materia
Fecal
ST 472/01
. Negro
Rio
.
Materia
Fecal
ST425/03
.
Misiones
.
Materia
Fecal
ST 1134/01
. Negro
Rio
.
Materia
Fecal
ST256/02
.
Jujuy
.
Sangre
.
Sangre
Brote
2004
Shigella spp.
Base de Datos Nacional:
 217 aislamientos, 137 patrones
 Especies y serotipos incluidos

S. sonnei: 174 aislamientos/95 patrones XbaI PFGE
S. flexneri: 55 aislamientos/42 patrones XbaI PFGE
S. flexneri: evaluación de protocolos
de PFGE
Protocolo S. sonnei
Switch time: 2.2 a 54.2 seg
Calles 2, 3, 4, 5, 7 y 8: Shigella flexneri serotipo 2.
Calles 9, 10, 13 y 14: Shigella flexneri serotipo 6.
Calle 12: Shigella flexneri serotipo 1
Calles 1, 6, 11 y 15: Salmonella Braenderup H9812
Protocolo C. jejuni
Switch time: 6.8 a 35.4 seg
Shigella spp.
Brotes estudiados (2002-2006):
S. sonnei: 4 brotes

(47 aislamientos, 6 patrones de XbaI PFGE y 10 patrones de BlnI)

Brote 1: 11 aislamientos, 2 patrones XbaI y 3 BlnI

Brote 2: 15 aislamientos, 3 patrones XbaI y 4 BlnI

Brote 3: 10 aislamientos, 1 patrón XbaI y 1 patrón BlnI

Brote 4: 10 aislamientos, 1 patrón XbaIy 1 patrón BlnI
Brotes causados por S. sonnei 2002-2006
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
100
95
PFGE-XbaI
90
85
80
PFGE-XbaI
Brote 2
Brote 3
Brote 1
Brote 2
Brote 2
Brote 4
SS466/02
Argenti. Neuquen
Neuquen
SS468/02
Argenti. Neuquen
Neuquen
SS473/02
Argenti. Neuquen
Neuquen
SS203/01
Argenti. Rio Negro
Viedma
SS130/03
Argenti. Salta
Salta
SS132/03
Argenti. Salta
Salta
SS133/03
Argenti. Salta
Salta
SS729/05
.
Argenti.
Salta
Salta
SS878/05
.
Argenti.
Salta
Salta
SS580/02
Argenti. Buenos Aires
Azul
SS582/02
Argenti. Buenos Aires
Azul
SS1173/05 Argenti.
.
Río Negro
Viedma
SS1236/01 Argenti. Buenos Aires
Mar del P.
SS460/02
Argenti. Neuquen
Neuquen
SS578/02
Argenti. Buenos Aires
Azul
SS583/02
Argenti. Buenos Aires
Azul
SS1975/05 Argenti.
.
Córdoba
Córdoba
SS458/02
Argenti. Neuquen
Neuquen
SS459/02
Argenti. Neuquen
Neuquen
SS462/02
Argenti. Neuquen
Neuquen
SS275/06
.
Argenti.
Entre Rios
Parana
SS282/06
.
Argenti.
Entre Rios
Parana
SS283/06
.
Argenti.
Entre Rios
Parana
SS747/06
Argenti. Entre Rios
Parana
Shigella spp.

Brotes estudiados (2002-2006):
S. flexneri: 2 brotes

Brote 1: 2 aislamientos de S. flexneri 2, 1 patrón XbaI
PFGE y 1 patrón BlnI PFGE

Brote 2: 8 aislamientos de S. flexneri 3, 2 patrones
XbaI y 2 de BlnI PFGE
Brote causado por S. flexneri 3
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
100
PFGE-XbaI
90
80
PFGE-XbaI
SF384
SF60/04
.
Argentina
Salta
Sa
SF66/05
.
Argentina
Rio Negro
Ba
SF262/04
.
Argentina
Buenos Aires
La
SF1237/05
.
Argentina
Buenos Aires
La
SF2013/05
Argentina
Buenos Aires
La
SF2016/05
Argentina
Buenos Aires
La
SF2012/05
Argentina
Buenos Aires
La
SF2015/05
Argentina
Buenos Aires
La
SF2017/05
Argentina
Buenos Aires
La
SF2018/05
Argentina
Buenos Aires
La
SF2019/05
Argentina
Buenos Aires
La
SF2020/05
Argentina
Buenos Aires
La
SF311
SF816
SF603
Brote año
2005
SF200
Vibrio cholerae

Protocolo estandarizado año 2005, instalación
“PulseNet script” año 2006

Estudios anteriores:
Diversidad genética V. cholerae O1 y no-O1

Análisis con protocolo PulseNet:
21 aislamientos de V. cholerae O1
(clon epidémico brotes 1992-1998, Variante
Tucumán, aislamiento 2005): 10 patrones SfiIPFGE
Vibrio cholerae
Dice (Opt:1.50%) (Tol 1.5%-1.5%) (H>0.0% S>0.0%) [0.0%-100.0%]
100
95
90
85
SfiI
80
75
SfiI
PE151/02
SO578
ARG58/93
Clon epidémico 1992 - 1998
ChFRIAS1
ChPEÑALOZA
F69
SF220
SF336
Aislamiento año 2005
Aislamientos año 2000
SFCARDOZO
ChA/TCOL1
SF366(2)
T12550
T12550/#1
T2220
T612/W
T777
T610
Variante Tucumán
T13074
T522
T5957
T1437
Dendograma de relación genética de aislamientos de Vibrio cholerae O1 de Argentina
PFGE con la enzima SfiI
GRACIAS!!!!!
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