Resolviendo el
Rompecabezas de
la Genomica
Reunión de distribuidores RASA
Noviembre 2009
Michael Sleeper Associate VP-International Marketing
Selección genómica
completa
Fuentes de información
Evaluación Genética
Tradicional
Predicción Genómica
► Pedigrí
► DNA-Basado
registrado
► Fenotipo
del animal
/progenie/familiares
en Pedigrí
► Fenotipo
del animal
/progenie/familiares
► Genotipo Animal
Como utilizar la Genómica
► Aplicar la selección Genómica (SG) al
desarrollo de programas de toros de I.A.
► Selección de toros de servicio para su uso
en los establos
► Selección de hembras para cría
► Futuros usos potenciales
– Cruzamientos dirigidos por computadora
– Manejo preciso y cuidado veterinario de las
hembras
Programa Genético Tradicional de I.A.
Selección del Padre
►Toro probado por progenie con el 85%
CONF- MN
– Promedio +100 hijas, 200 dias en prod.
►Promedio 25-30 hijos por Toro
– Alto, 80 hijos; Bajo, 5 hijos
►Típicamente 30 toros como padres por
año
Programa Genético Tradicional de I.A.
Selección de la Madre
►En promedio se seleccionan las hembras
a los 30 meses
– 1era lactancia 3-6 meses en la lactancia
– Contrato para lavado en la 1era o 2da
lactancia
►Excepciones
– 25% vaquillas vírgenes
– 25% 3era lactancia o mas grandes
Programas Genéticos
Tradiconales de I. A. (cont.)
► 43 meses después, los toros jóvenes (TJ)
tiene pruebas de progenie (80%
confiabilidad, MN$)
► TJ es considerado probado y es desechado
o regesa al servicio activo
► El costo promedio de una prueba de
progenie por TJ es de US$30,000
– 32% del costo total, periodo de espera
Programa Genético de I.A. con SG
► Selección adecuada entre hermanos completos para
prueba de progenie
► Venta temprana de semen de toros jóvenes (TJ) elite
– Frecuentemente la “mejor” opción para un progreso
genético
► Aumento del no. de toros como padres
– Combinar TJ y con toros con prueba de progenie
► Aumentar el no. de madres
– Aumenta la proporción de vaquillas virgenes con SG
Evaluación de
hermanos completos
Prom.
padres MN$
% Conf.
Toro
Padre
CASH
RAMOS
+ $638
35%
CASSINO
RAMOS
+ $638
35%
CHESTER
RAMOS
+ $638
35%
Evaluación de
hermanos completos
Toro
MNV$
Genómico
%Conf.
Genómica
Diferencia
con el PP
CASH
+ $560
76%
- $78
CASSINO
+ $800
75%
+ $162
CHESTER
+ $615
76%
- $23
Genómica
Tradiconal
La velocidad de la Genómica
Becerro
recogido
del
establo
Nacimiento
becerro
Distribución
de semen
en hatos
para prueba
Toro promovido
como Activo
1eros
becerros
nacidos
Colección
de semen
Parto de la
hijas
Edad Toro
0 3 me
7 me
Nacimiento
becerro
Se recibe
su prueba
genómica
24 me
15 me
Colección
de semen
Distribución
de semen
en hatos
para prueba
24 me
30 me
1eros
becerros
nacidos
48 me
Parto de
las hijas
Toro promovido
como Activo
60 me
Impacto del Progreso
Genético
D G=
Intensidad de la
selección (i)
x Exactitud (r) x Variación (s)
Intervalo Generacional (L)
Conflicto de influencia
materna
►La genómica no remueve
completamente el sesgo de influencia
materna si esta presente
►Prom. de sesgo $80 MNV para toros
jóvenes
►Accuracia en la selección de las
madres ¡es la clave!
GENESIS y la genómica
►Menor intervalo generacional
►Selección exacta y temprana de
hembras
►Nivel genético mejorado de los toros
que se comercializan
Historia del programa GENESIS
1989
Inicio del programa
1991
Stony Hill es construido
1999
Vacas en leche a Harmony-Ho
2001
Se añade un 2do hato cooperador– United
Pride
2005
Vacas elite enviadas a Sunshine Genetics
2006
Se introducen hatos satélites
2008
Pruebas genómicas disponibles
2009
Hatos núcleo introducidos
Resultados del Programa
GENESIS
► Proporciones de graduación exceden los
tradicionales
– GENESIS
– Criadores
1 en 7toros
1 en 10 toros
► 15 toros CO-OP activos con las pruebas de
Agosto ‘09
O-STYLE
MASSEY
LOGAN
CORY
LOYDIE
$793 LNM
$762 LNM
$732 LNM
$718LNM
$691 LNM
COLE
KARSTEN
CAVANA
ALABAMA
LAZARITH
$776 LNM
$748 LNM
$718 LNM
$710 LNM
$626 LNM
Resultados del programa
GENESIS
►Hembras GENESIS son reconocidas
como elite en la industria con la pruebas
genómica
– Hija de Planet
#1 MNV $955
– Hija de Shottle
#1 GTPI 2500+
– 3 hembras con
$900+ MNV
– 5 hembras con
$800+ MNV
– 35 hembras con
$700+ MNV
El plan de CRI
►Contratos agresivos para toros
►Probar tantos toros como sea posible
►Identificar a las mejores hembras
►Utilizar los mejores toros disponibles
jóvenes o viejos
►Maximizar GENESIS
El plan de CRI
Adquisición de Toros
► Aumentar el número de cruzamientos planeados
► Valor genómico de todos los becerros resultantes
antes de seleccionar entre hermanos completos
► Reducir la edad de los padres con prueba
genómica
► Manejar la diversidad genética
► Reconocer el valor agregado de un contrato de
cruzamiento planeado
– Competencia feroz, 1st por la 1era opción
– Mayor exactitud
El plan de CRI
Hatos en Prueba de Progenie (PP)
► Menos toros en PP
► Menos capacidad de muestreo
► Selección de hatos para prueba de
progenie
– Calidad de manejo de alto nivel
– Uso eficiente de semen
– Calidad del manejo de datos
►Mercadeo directo del mejor 20%
El plan CRI
Mercadeo de la Genómica
►Los toros activos con prueba de progenie usan
datos genómicos en la estimación de su PTA
– Resulta en pruebas estables
►Los toros activos con prueba genómica ofrecen
mayor oportunidad
– Casi 40 toros genómicos
– Líder en la industria de paquete genetico completo
Activos genómicos: Agosto
 Ahora 365 genómicos activos, todos los
centros
– 100 mas que en Abril
 Promedios de la Industria CRI
+$556 LNM
2008 TPI™
+1411 Milk
+3.5
PL
- 0.3
DPR
+3.22 PTAT
+2.79 UDC
Coded active, 4/09 USDA-AIPL
+$633
2048
+1523
+4.7
+0.5
+2.79
+2.65
Activos genómicos, por
centro
Centro
Prom
# Activos
MNV$
Prom
TPI
Prom VP
Prom
TPH
CRI
47
633
2048
4.7
0.5
Select
87
556
2005
3.8
-0.2
Alta
16
579
1986
3.4
0.1
Accel
19
632
2083
4.6
0.3
ABS
23
560
2011
3.5
-0.4
Semex
55
527
2001
2.8
-0.9
Coded Active, 4/09 USDA-AIPL
Toros genómicos Elite
Centro
# > 700 MNV$ # > 6.0 VP # > 2.0 TPH
CRI
13
10
8
Select
14
7
1
Alta
1
1
1
Accel
7
3
1
ABS
8
2
0
Semex
6
1
2
Coded Active, 4/09 USDA-AIPL
Cambios a los toros genómicos con
la adición de hijas
Rasgo
Enero
Agosto
Promedio cambio
Milk
+1157
+1068
-89
LNM$
404
362
-42
LNM$ Rel
68
79
+11
• 182 toros con prueba genómica en Enero y se
añadieron hijas en agosto (promedio 60 hijas)
• Muy temprano para otros rasgos
• Pocas, si algunas, hijas en su prueba de tipo
4/09 & 1/09 &12/08 USDA-AIPL
Genomics, Plus Daughters
►34 genomic bulls active in January
►8 now have daughters
$608 LNM (Aug.)
$649 LNM (Jan.)
►6 have daughters classified
+2.15 PTAT, +2.39 Udder (Aug.)
+2.26 PTAT, +2.29 Udder (Jan.)
Did Genomic Bulls Change?
Trait
January
August
Average Change
Milk
1227
1228
+1
Prod Life
3.3
3.1
-0.2
PTA Type
2.01
1.99
-0.02
LNM$
477
465
-12
LNM$ Rel.
66
71
+5
► 778 CRI genomic-proven bulls in January, compared
to August genomic proof (no daughters yet)
► Genomic proofs changed very little
– Can change as other family members
genomic tested, or sire/dam proof changes
4/09 & 1/09 USDA-AIPL
Type Changes:
All Genomic Bulls With Daughters
Trait
January
August
Avg Change
Type
+1.52
+1.41
-0.11
• 58 Code 1 bulls with genomic proof in January and classified daughters in
August
(average 32 daughters)
8/09 &12/08 USDA-AIPL
Elite for Profit
17 Code 1 Over $700 Net Merit!
Lifetime Net Merit
Lineup
# Active
Sires*
Stud
Av.
Stud Av.
Percentile
LNM$
LNM$
# of Sires
90th %
LNM$
CRI
108
94
$557
72
Select Sires
Alta
Accelerated
ABS
Semex
191
109
95
130
71
84
70
76
73
54
$459
$386
$411
$401
$323
77
17
28
38
10
* Genomic & progeny, August 2009
Top 15 LNM$
LNM$
DTRS
1HO8784
FREDDIE %-I
911
60
1HO9208
SHAMPOO
829
G
SEBASTIAN
824
G
1HO2565
CASSINO %-I
800
G
1HO8778
SUPER
797
94
1HO9167
O-STYLE
793
G
1HO9192
HILL
780
G
1HO2571
COLE
776
G
1HO9527
MASSEY
762
G
New 1HO9952
KARSTEN %-I
748
G
New 1HO8658
LOGAN
732
88
ARTHUS
722
G
CORY
718
G
1HO9040
CAVANA
718
17
1HO9315
ALABAMA
710
G
New 1HO2683
1HO2460
New 1HO9928
Elite for Longevity
# Active
Sires*
Stud Av.
PL
# of Sires
90th% PL
CRI
108
4.0
30
Select Sires
Alta
Accelerated
ABS
Semex
191
109
95
130
71
2.8
1.9
2.4
2.4
1.0
21
5
13
11
0
Stud Code
* Genomic & progeny, August 2009
Top 15 Longevity
PL
DTRS
1HO8784
FREDDIE %-I
8.9
60
1HO8778
SUPER
7.9
94
New 1HO2684
RETAIL %-I
7.6
G
New 1HO2683
SEBASTIAN
7.3
G
New 1HO8631
LES
7.2
114
CASSINO %-I
6.9
G
SLY
6.8
G
1HO6360
WIZARD
6.8
27,201
1HO9208
SHAMPOO
6.6
G
1HO9167
O-STYLE
6.6
G
1HO9103
CABHI
6.6
G
1HO8521
DANGER
6.6
75
1HO2980
RAKUUNA %-I 6.4
173
New 1HO9952
KARSTEN %-I 6.2
G
VARS %-I
G
1HO2565
New 1HO9137
1HO8927
6.2
Elite for Cow Fertility
# Active
Sires
Stud Av.
DPR
# of Sires
90th% DPR
CRI
108
0.6
19
Select Sires
Alta
Accelerated
ABS
Semex
191
109
95
130
71
-0.2
-0.2
-0.1
0.0
19
7
10
15
1
Stud Code
* Genomic & progeny, August 2009
DPR
WIZARD
3.7
27,201
LES
3.6
114
1HO8784
FREDDIE %-I
3.5
60
1HO8927
VARS %-I
3.3
G
1HO8521
DANGER
3.2
75
SEBASTIAN
2.8
G
O-STYLE
2.8
G
KASEY-P-RED 2.5
CABHI
2.4
G
New 1HO9137
SLY
2.3
G
New 1HO2684
RETAIL %-I
2.3
G
1HO8789
TURN
2.3
92
1HO8778
SUPER
2.1
94
1HO8919
INFINITE
2.1
G
MONTA
2.0
G
1HO6360
Top 15 Cow Fertility
DTRS
New 1HO8631
New 1HO2683
1HO9167
New 1HO2590
1HO9103
New 1HO9673
G
Elite For Production
Lineup
# Active
Sires
Milk
Stud Av.
Milk
# of Sires
90th % Milk
CRI
108
1326
18
Select Sires
Alta
Accelerated
ABS
Semex
191
109
95
130
71
1186
1222
1277
1023
1028
25
10
16
12
5
* Genomic & progeny, August 2009
Top 15 Milk
1HO9248
SIGNIF-P
2976
G
1HO9184
SPA
2570
G
1HO9192
HILL
2517
G
1HO2531
HEFTY
2442
G
1HO2490
CHARL ISY %-I
2375
G
1HO9092
LAZARITH
2301
G
CORY
2290
G
SHARKY
2267
3096
KARSTEN %-I
2248
G
1HO2460
ARTHUS
2190
G
1HO7900
EARNIT
2173
152
1HO8556
ARCHER
2172
86
1HO8987
CHARLES
2126
G
1HO8778
SUPER
2114
94
1HO8430
PY *RC
2111
107
New 1HO9928
1HO7127
New 1HO9952
Top 15 Udders
UC
DTRS
1HO9309
IAN
3.94
G
1HO9543
KOLTON
3.87
G
1HO9192
HILL
3.76
G
1HO9544
KAMPMAN
3.74
G
1HO2584
ANTON
3.55
G
1HO8878
PALM
3.47
G
1HO9554
HICLASS
3.44
G
1HO2531
HEFTY
3.32
G
SEBASTIAN
3.31
G
1HO8997
PENOSH
3.28
G
1HO9225
DON JUAN
3.26
G
1HO9527
MASSEY
3.19
G
CORY
3.14
G
TASTIC
3.04
G
COCOMO %-I
3.03
G
New 1HO2683
New 1HO9928
1HO2543
New 1HO2621
New Pedigree Choices
LNM
Dtrs
1HO9952 KARSTEN %-I 748
G Ramos x Lancelot x BW Marshall
1HO2611 SEQUOIA
704
G Boliver x Ramos x Addison
1HO9137 SLY
689
G Potter x Orion x Belwood
1HO2684 RETAIL %-I
677
G Ramos x Durham x Mtoto
1HO9673 MONTA
615
G Toystory x Lynch x Onward
1HO2680 MALVO
614
G Zenith x Wizard x BW Marshall
1HO9528 BUCKO %-I
604
G Boliver x Wizard x Lynch
1HO7973 MELVIN
567
1HO2621 COCOMO
501
110 Ramos x RC Marshall x Celsius
G Baxter x Lancelot x Trent
9 new bulls with no O Man or Shottle
and over $500 LNM
Choose a Toystory
Son
1HO9673
From the same family in GENESIS
1HO2571
COLE
1HO9928
CORY
Toystory x O Man x Orion
Toystory x Shottle x Orion
+$776 LNM
+3.2 PL
+3.28 Type
+2.53 UDC
7% SCE
+2.8 SCR
+$718 LNM
+4.0 PL
+2290 Milk
+3.36 Type
+3.14 UDC
+1.2 SCR
MONTA
Toystory x Lynch x
Onward
+$615 LNM
+4.4 PL
+2.0 DPR
Plus percents
+2.66 Type
+2.67 UDC
+2.2 SCR
Compra y uso de Semen
► ¡Confíe en los números!
► Mejor regla general:
– El nivel genético determina el uso de un toro
– El nivel de confiabilidad determina cuantos
toros usar? (las extensionistas)
– 5 toros por cada100 vacas, 6 meses
– 20 toros, 1000 vacas 6 meses
– 1 toro por 2 periodo de 6 meses
Preguntas y
Discusión
Michael Sleeper, CRI
[email protected]
Descargar

Dairy Cattle Genomics A New Era in Genetic Improvement