Tutorial de Uso Metamorph:
Montaje de videos.
Unidad de Microscopia
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Introducción.
•
Entre las principales aplicaciones del METAMORPH está la posibilidad de realizar :
•
TIMELAPSE(Series Temporales).
•
Z –SERIES (Series en z).
•
Una vez obtenida la secuencia de capturas para cualquiera de estas 2 aplicaciones es posible
montar un video .
¿cómo ?
•
1-Para “Timelapse” hay que realizar 2 pasos :
1º- montar un “visor galeria” para cada grupo de imágenes .
2º- montar el video a partir del visor galería creado previamente.
•
2-Para” Z-Series” es suficiente con 1 único paso :
las capturas en Z se guardan directamente en formato “Visor galería”y a partir
de estas se puede montar DIRECTAMENTE un video o bien fusionar todos los
planos en una única imagen.
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Como interpretar los archivos
guardados para el montaje de video.
Los archivos capturados en un
TIMELAPSE se deben interpretar del
siguiente modo para el montaje de videos:
(1)-Se genera una copia con
extensión_THUMB de cada archivo de
captura , estos no deben montarse ,son
archivos accesorios que el programa
necesita temporalmente para permitir el
montaje de la película.
(1)
Solo nos interesan el resto de archivos
(2)
-En este caso deberíamos
montar 4 grupos de series:
para 2 canales (luz
transmitida y GFP) y 2
puntos de muestreo
(s1 y s2) para cada canal.
-Integrando para cada una
de estas 4 series la fusión
de los archivos de los 5
tiempos de muestreo(t1-t5)
(2)-Los archivos se guardan (y deben
montarse) en grupos: por número de
canales usados en el
experimento(extensión inicial) y por
puntos(s) y tiempos de muestreo(t).
Así cada archivo presentará
-un código inicial del canal de captura:
luz transmitida,GFP,Cy3,etc y
-un código final para puntos y tiempos de
muestreo:
S(space)(punto de muestreo)
T(time)(tiempo de muestreo)
De este modo,tendremos que montar cada grupo de
imágenes para cada canal y punto de3muestreo.
Como interpretar los archivos guardados tras captura
THUMBS
Muy iportante los
archivos thums no son
mas que pequeñas
muestras de la captura
pará ver en un modo
galeria global .
1
2
4
No son necesarios para el
montaje de peliculas y
podemos deseellcionar su
guardado para no
acomplejatr el proceso
de montaje de videos
mediante la deseelccion
de la correspodiente
casilla en EDIT:
IMAGE
PREFERENCES.
3
4
Imágenes integradas
en un MODO VISOR GALERIA
Los thumbs pueden
usarse para ver la galeria
en el modo BUILD
4
CATALOG del FILE.
Montar PELICULAS 1
Montaje Video
1
2
4
Paso 1: MONTAR VISOR
GALERIA(secuencia de capturas).
(1)Abrimos en el menú OPEN>>Open Special
>>Build Stack>>Numbered Names
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(2)Se abrirá una nueva pantalla donde tenemos
q seleccionar FIRST IMAGE....así vamos a la
carpeta donde hemos guardado nuestras
capturas y seleccionamos la primera imagen de
la serie a montar:
las capturas están nombradas y separadas
para cada canal/fluorocromo de captura y
con extensiones finales numéricas para los
puntos de muestreo(S) y tiempos de Captura
(T).
(3)Clicamos en OK en la primera imagen de la
serie a montar(first image) y a continuación
introduciremos la última captura para esa serie
(last image).
4
Imágenes integradas
en un MODO VISOR GALERIA
(4)-Clicamos en OK y se generará un VISOR
GALERIA que integra el total de capturas de la
serie montada y por el cual podemos movernos
a través de una barra corredera (barra superior).
Guardamos nuestra galería para poder montar
posteriormente una película si nos interesase.
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Paso 1: montar un VISOR GALERIA
Montaje de Videos
PASO 2: MONTAJE DE VIDEOS
Una vez montado el “visor galería” podemos crear , a
partir de este, una película de video.
1
¿CÓMO MONTAR LA PELICULA ?
(1)- Vamos a STACK >> STACK MOVIE
(2)-Abrimos el VISOR creado previamente y
lo cargamos en SOURCE STACK
(3)-Seleccionamos los planos del total que
queremos integrar en nuestra película.
2
4
(4)-Seleccionamos FORMATO : bien
.avi(mediaplayer)
o bien .mov(quicktime)
-Seleccionamos frames para la película (un
valor de 1-3 es adecuado).
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-Clicamos en SAVE y creamos el video de
nuestra secuencia de capturas(antes de guardar
deberemos elegir formato de compresión para
la película , por defecto usamos modo SIN
COMPRESIÓN ).
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Paso 2: montar un VIDEO
Tutorial Metamorph: Montaje de Videos
-Introducción...............................................................................................2
-Como interpretar los archivos guardados tras captura..............................3
-Paso 1: montar un “visor galería”...............................................................4
-Paso 2: montar un video.............................................................................5
Unidad de Microscopía
Centro de Investigación del Cáncer
Campus Miguel de Unamuno 37007 Salamanca (Spain).
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Tutorial 3: Como montar videos a partir de timelapse y Z series